Mae egwyddor weithredol peiriant rhwygo gwastraff meddygol yn dibynnu'n bennaf ar gneifio mecanyddol a gwasgu effaith. Mae'r offer yn defnyddio disg torrwr cylchdroi cyflym a llafnau i dorri, rhwygo a malu'r gwastraff meddygol mewnbwn. Mae'r gwastraff yn gwrthdaro ac yn rhwbio'n barhaus o fewn y siambr rhwygo, gan gael ei falu'n raddol yn ronynnau neu'n ddarnau bach i'w sterileiddio neu eu trin wedyn. Gall y dull rhwygo mecanyddol hwn brosesu gwahanol fathau o wastraff meddygol, gan gynnwys plastigau, rwber a phapur, tra'n lleihau cyfaint gwastraff.
Mae system bŵer y peiriant rhwygo yn hollbwysig wrth yrru'r broses rwygo. Mae'r modur yn gyrru'r disg torrwr i gylchdroi trwy leihäwr neu'n uniongyrchol, ac mae'r llafnau'n torri'r gwastraff ar gyflymder uchel. Mae'r cyflymder cylchdroi, nifer y llafnau, a chynllun y disg torrwr yn pennu effeithlonrwydd rhwygo a maint gronynnau allbwn. Mae'r grym allgyrchol a'r grym cneifio a gynhyrchir gan gylchdroi cyflym yn malu'r gwastraff yn y siambr rwygo'n gyflym a'i ollwng yn gyfartal, a thrwy hynny wella effeithlonrwydd prosesu. Darperir system amddiffyn diogelwch a rheoli rhyddhau hefyd. Yn nodweddiadol mae gan y fewnfa fwydo ddyfais amddiffynnol i atal gweithredwyr rhag cysylltu â'r llafnau; mae'r allfa rhyddhau wedi'i chynllunio i sicrhau bod y gwastraff wedi'i rwygo'n cael ei ollwng yn llyfn. Gall y system reoli addasu pŵer a chyflymder y modur ac atal y peiriant yn awtomatig rhag ofn y bydd gorlwytho neu rwystr, gan sicrhau gweithrediad diogel yr offer. Trwy weithrediad cydgysylltiedig systemau malu a rheoli mecanyddol, mae peiriannau rhwygo gwastraff meddygol yn cyflawni triniaeth gwastraff effeithlon, rheoladwy a hylan.